乳中不同体细胞数的新疆褐牛STAT5B基因表达及生物信息学分析

刘攀; 姜徽; 巨星; 王丹; 田月珍; 付雪峰; 李媛媛; 苟穆荣; 王震; 樊琛; 布佐拉姑丽·库尔班; 黄锡霞

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新疆褐牛是我国育成的首个乳肉兼用牛品种,具有抗逆性强、体细胞数低、耐粗饲的优点,拥有西北第一牛的美称。前人研究发现,STAT5B基因与新疆褐牛的泌乳性状有关,为了进一步探索STAT5B基因对新疆褐牛泌乳性状的影响,通过采用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)对STAT5B基因在不同乳房健康程度的新疆褐牛血液中的相对表达量进行分析;同时使用NCBI Blast、ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODE、MEGA、TMHMM Server v.2.0、SignalP-5.0 Server、WoLF PSORT等生物信息学分析软件对STAT5B基因编码的蛋白进行结构分析与功能预测。RT-qPCR结果表明:STAT5B基因对奶牛乳房炎影响不显著,但STAT5B基因在健康新疆褐牛血液中的表达量高于患乳房炎的新疆褐牛。生物信息学分析结果表明:STAT5B基因编码蛋白的分子式为C_(4006)H_(6263)N_(1111)O_(1197)S_(25),共编码787个氨基酸;进化树分析结果表明牛STAT5B基因与水牛的亲缘关系较为接近;经预测STAT5B基因编码的蛋白质是一种亲水性蛋白,主要由亮氨酸组成;该蛋白中α-螺旋高达50.95%,β-折叠的含量最少。该分析及预测结果主要为探索新疆褐牛STAT5B基因的功能奠定基础,为阐明其对新疆褐牛泌乳性状的影响提供了理论依据。

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来源
《中国畜牧杂志》 |2022年第2期|106-112|共7页
作者
刘攀; 姜徽; 巨星; 王丹; 田月珍; 付雪峰; 李媛媛; 苟穆荣; 王震; 樊琛; 布佐拉姑丽·库尔班; 黄锡霞;
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作者单位

新疆农业大学动物科学学院;

新疆畜牧科学院;

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正文语种 chi
中图分类 S823.2;
关键词
新疆褐牛; STAT5B; RT-QPCR; 生物信息学分析; 体细胞数;

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