德保矮马X染色体选择信号筛选

刘雪雪; 阿地力江·卡德尔; 董坤哲; 王月月; 潘建飞; 浦亚斌; 何晓红; 马月辉; 蒋琳

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德保矮马X染色体选择信号筛选

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旨在对德保矮马(Debao pony)X染色体的选择信号进行筛选.本研究利用Illumina公司开发的马芯片Equine 65K SNP BeadChip,对德保矮马、伊犁马、蒙古马进行X染色体扫描,获得2 339个SNPs位点.通过群体分化系数FsT法和XP-EHH两种不同的方法,分别以伊犁马和蒙古马为对照群体对德保矮马进行X染色体选择信号检测.结果,筛选到两个受到较强选择区域4.0～39.9和87.1～123.5 Mb,包含64个“离群位点”.通过基因注释筛选到PHEX、BCOR、PNPLA4和GPC3等与生长和骨骼发育相关的基因.研究结果发现,德保矮马的选育过程中X染色体很多与生长相关的基因受到了强烈的选择,其中部分在马中未见报道,可以作为研究矮小性状的重要候选基因.

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来源
《畜牧兽医学报》 |2015年第12期|2161-2168|共8页
作者
刘雪雪; 阿地力江·卡德尔; 董坤哲; 王月月; 潘建飞; 浦亚斌; 何晓红; 马月辉; 蒋琳;
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作者单位

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;

甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州730070;

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;

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正文语种 chi
中图分类马;
关键词
德保矮马; FST; XP-EHH; X染色体; 选择信号;

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