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湘西黄牛Myf5和Pax7基因的SNPs检测及其与体尺性状的关联分析

         
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本研究旨在检测湘西黄牛Myf5和Pax7基因的单核苷酸多态性(SNP),探讨湘西黄牛多态性位点的群体遗传特征,寻找与生长发育相关的分子标记.采用PCR和直接测序技术筛查湘西黄牛Myf5基因第2内含子和Pax7基因第3外显子的SNPs;以217头湘西黄牛为研究对象,采用PCR-RFLP方法对群体进行遗传多态性分析,运用最小二乘线性模型进行基因型与体尺性状的关联分析.结果表明,在湘西黄牛Nyf5基因第2内含子中检测到9个SNPs,其中7个是本研究新发现的SNPs;在Pax7基因第3外显子检测到1个SNP.群体遗传多态性分析结果显示,湘西黄牛群体中Myf5基因g.1948A＞G位点的AA、AG和GG基因型频率分别为0.046 1、0.235 0和0.718 9;A和G等位基因频率分别为0.163 6和0.836 4.Pax7基因g.31G＞A位点只检测到AG和GG 2种基因型,基因型频率分别为0.073 7和0.926 3;A和G等位基因频率分别为0.036 9和0.963 1.这2个位点均处于低度多态,且达到了Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).关联分析结果表明,Myf5基因g.1948A＞G位点的AA和AG型个体的体重显著高于GG型个体的体重(P＜0.05),A等位基因对体重为正效应;而各基因型间的体高、体长和胸围的差异均不显著(P＞0.05).结果提示,湘西黄牛Myf5基因的SNP位点较多,g.1948A＞G位点可能为湘西黄牛体重性状的分子遗传标记位点.

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