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H1N1猪流感广东株血凝素基因的克隆与序列分析

         

摘要

用RT-PCR方法扩增H1N1亚型猪流感病毒广东分离株A/Swine/GuangDong/711/2001 HA基因,对其进行了克隆和测序.结果显示,HA基因全长1 771 bp,共编码579个氨基酸.A/Swine/GuangDong/711/2001 HA基因编码的氨基酸序列中有8个糖基化位点,5个位于HA1基因的第27、28、40、104和287位点,3个位于HA2基因的21、153和213位点.与H1N1亚型猪流感经典毒株比较后发现,血凝素糖基化位点并不是高度保守的.将A/Swine/GuangDong/711/2001与自GenBank读取的1918年人流感毒株A/South Carolina/1/18、1991年人流感毒株A/MD/12/91和1997年猪流感毒株A/Swine/Wisconsin/238/97等进行核苷酸同源性比较分析,A/Swine/GuangDong/711/2001与A/South Carolina/1/18、A/MD/12/91和A/Swine/Wisconsin/238/97等毒株的核苷酸同源性分别为93.9%、94.7%和93.9%.从系统发生树来看,A/Swine/GuangDong/711/2001与A/South Carolina/1/18和A/Swine/Wisconsin/238/97的亲缘关系相近.

著录项

  • 来源
    《畜牧兽医学报》 |2005年第2期|172-176|共5页
  • 作者单位

    甘肃农业大学动物医学院,兰州,730070;

    中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室,哈尔滨,150001;

    甘肃农业大学动物医学院,兰州,730070;

    中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室,哈尔滨,150001;

    甘肃农业大学动物医学院,兰州,730070;

    中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室,哈尔滨,150001;

    中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室,哈尔滨,150001;

    中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室,哈尔滨,150001;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 负股单股RNA病毒;
  • 关键词

    猪; 流感病毒; 血凝素基因; 克隆; 序列分析;

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