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两种Actinobacteria鉴定方法的比较

         

摘要

Actinobacteria classis nov.一般包括具有超过50% G+C的DNA碱基组成的微生物。其中的一些菌种在生物技术和医药方面具有重要的意义。为了分离能产生有用物质的新型微生物,我们扩大了分离对象,从以前的Streptomyces和Streptomyces以外的放线菌扩大到所有的Actinobacteria。本论文实验中的Actinobacteria将特指那些具有普通细菌形态的高G+C含量革兰氏阳性细菌。为了能够将Actinobacteria和其它革兰氏阳性低G+C含量的细菌加以区分,我们建立了两种鉴定方法。一种是荧光原位杂交(FISH)方法,它具有准确和直观的优点。另外一种是PCR方法,因在Actinobacteria 23S rRNA基因的domain Ⅲ(螺旋区54a)有1个大约100个碱基的稳定插入片段,通过体外PCR扩增23S rDNA片段,并用琼脂糖电泳分析,可以简便地鉴定Actinobacteria。

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