酸性条件下的DNA构象变化加速DNA变性解链

严磊; 毛秀海; 左小磊

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酸性条件下的DNA构象变化加速DNA变性解链

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摘要

调控DNA的变性解链过程是DNA扩增与检测的关键步骤。对于传统的热循环DNA扩增策略,由于变温过程中热量分布不均一以及变温速度慢等不利因素,会直接影响DNA变性解链过程,从而降低DNA检测放大的效果、延长检测的时长。因此,探索快速、高效的调控DNA变性解链的方法具有重要的研究意义。本文发展了以胞嘧啶在酸性条件下的质子化反应为基础,通过改变溶液的pH值,来诱导DNA构象在Watson-Crick(WC)碱基对与Hoogsteen(HG)碱基对之间的分子构象转换,从而实现精准、快速、高效的DNA变性解链调控目标。结果表明,相较于传统的温控方法,pH调控方法能显著提高DNA变性的速率约6倍以上。本文发现pH调控方法通过降低双链DNA的反应焓约160 kJ/mol,从而提高双链DNA变性速率和效率。该方法具有用于DNA信号放大与检测等相关应用的潜力。

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来源
《应用化学》 |2022年第5期|837-842|共6页
作者
严磊; 毛秀海; 左小磊;
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作者单位

上海交通大学医学院附属仁济医院分子医学研究院;

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正文语种 chi
中图分类分析作业方法与技术;
关键词
DNA构象; DNA变性解链; PH值;

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