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新基因HERV-H-X的env区分析及其在结肠癌组织中的表达

         
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背景与目的:我们在结肠癌组织中发现了一个新的基因HERV-H-X。本研究的目的是分析HERV-H-Xenv区的缺失情况,研究其与其他HERV-Henv开放阅读框(open reading frames,ORF)的表达关系以及其在结肠癌与正常组织中的表达差异情况。方法:对HERV-H-X与含完整的envORF的HERV-H/env62、HERV-H/env60以及HERV-H/env59进行多序列比对,分析HERV-H-Xenv区的缺失情况。对HERV-H-X设计特异的引物,对HERV-H/env62、env60以及env59的envORF设计共同的引物,分别在8对结肠癌与相应癌旁正常组织中进行RT-PCR,比较它们的表达情况。对HERV-H-X进行实时荧光定量PCR,研究其在17对结肠癌与相应正常组织中的表达水平。结果:HERV-H-Xenv区缺失的序列正好相应于HERV-H/env62、env60以及env59的envORF区。RT-PCR结果显示HERV-H-X特异地在结肠的癌组织中表达,而HERV-Henv的ORF在结肠的癌组织与正常组织中都有表达。定量PCR结果显示HERV-H-X在结肠癌组织的平均表达水平是相应正常组织的24.9倍,经F检验证实差异有统计学意义(P<0.01)。结论:HERV-H-X的表达与结肠癌特异相关,但由于缺失env的ORF,其在结肠癌的高表达与env基因无关。

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