组蛋白翻译后修饰无标定量方法可靠性的比较

刘志伟; 朱明睿; 翟琳辉; 谭敏佳

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组蛋白翻译后修饰无标定量方法可靠性的比较

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组蛋白翻译后修饰是一种表观遗传学修饰,参与调控细胞的新陈代谢等重要生理过程.蛋白质组学发展迅速,使监控组蛋白翻译后修饰的动态变化成为可能.目前主要有3种无标定量方法(谱图计数法、峰面积积分法和信号强度法),但何种定量方法更可靠尚未见系统性的详细报道.在稳定同位素标记细胞培养技术(SILAC)基础上,对去乙酰化酶抑制剂(SAHA)调控细胞乙酰化修饰水平的定量数据进行对比,比较3种无标定量方法对组蛋白翻译后修饰进行的定量分析,利用定量结果的标准差(SD)评估定量的可靠性,最终发现基于峰面积积分法定量的结果可靠性最高.该研究对难以进行同位素标记实验的样本分析,尤其对临床样本、大样本的组蛋白修饰谱分析具有重要参考意义.

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来源
《色谱》 |2016年第9期|825-830|共6页
作者
刘志伟; 朱明睿; 翟琳辉; 谭敏佳;
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作者单位

中国科学院上海药物研究所新药研究国家重点实验室,上海201203;

中国科学院大学,北京100049;

中国科学院上海药物研究所新药研究国家重点实验室,上海201203;

中国科学院大学,北京100049;

中国科学院上海药物研究所新药研究国家重点实验室,上海201203;

上海市化学品分析、风险评估与控制重点实验室,上海200092;

中国科学院上海药物研究所新药研究国家重点实验室,上海201203;

中国科学院大学,北京100049;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类元素及化合物的分离方法;
关键词
组蛋白翻译后修饰; 无标定量; 可靠性;

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