数目可变串联重复序列分子指纹分型法鉴定北京基因型结核分枝杆菌

金嘉琳; 姜昕; 翁心华; 胡忠义; 张文宏

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数目可变串联重复序列分子指纹分型法鉴定北京基因型结核分枝杆菌

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目的探讨数目可变串联重复序列(VNTR)分子指纹分型法在北京基因型结核分枝杆菌菌株识别中的价值,并与间隔区寡核苷酸分型(Spoligoty-ping)法进行比较。方法对50株临床结核分枝杆菌行核酸抽提后,以12个VN-TR位点引物分别扩增,对所得的指纹图谱进行分析,并与Spoligotyping结果比较。结果本研究中采用的12个VNTR位点均具有多态性。Spoligotyping分型有88%(44/50)菌株为北京基因型。相同Spoligotyping基因型的43株菌用VN-TR可分为24种基因型。VNTR的各个多态性位点中对北京基因型菌株辨别力最高的是MIRU26位点。结论 VNTR可作为结核分枝杆菌分子流行病学调查的初筛方法,结合Spoligotyping可进行北京基因型菌株的识别。

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来源
《中华实验和临床感染病杂志（电子版）》 |2010年第4期|1-4|共4页
作者
金嘉琳; 姜昕; 翁心华; 胡忠义; 张文宏;
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作者单位

复旦大学附属华山医院传染科;

上海市复旦大学遗传所;

上海市肺科医院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 R339.38;
关键词
结核分枝杆菌; 数目可变串联重复序列; 间隔区寡核苷酸分型; 北京基因型;

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