Y-STR单倍型匹配概率与基因座数量关系的构建

莫晓婷; 杨成; 吴俞衡; 马温华; 尚蕾; 李万水

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Y-STR单倍型匹配概率与基因座数量关系的构建

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目的本文探索一种衡量Y-STR系统效能的方法,应用种群结构参数θ构建Y-STR单倍型匹配概率与基因座数量关系模型,旨在分析影响Y-STR检测系统效能进入平台期的因素,确定进入平台期的基因座数量区间.方法预测了体系中每个数量基因座对应的所有可能基因座组合子集,统计每个子集对应的θ值.统计了DNATyperY36(36)、Y filer plus(27)、PPY23(23)、Yfiler(17)等4个常用Y-STR检测系统在3个不同数量级模型库(873、9577和83999条)的θ值,构建数量关系模型.此外,还统计了5个Y-STR案件样本在数据库中的检索结果以验证理论模型的推导结果.结果在θ最大值的拟合曲线中,DNATyperY36系统在3个数量级数据库中进入平台期的节点分别是27、37和55个基因座;在θ最小值的拟合曲线中,该值分别是19、25和28个基因座.结论对数据库模型的研究表明,系统中Y-STR基因座数目的增加与θ值呈反比,随着基因座数目增加,其对θ值减小的影响逐渐降低,最终会进入"停滞效应",又称"平台期".数据库容量决定了系统进入平台期的节点,数据库容量越大,则进入平台期的节点越靠后,体系中纳入GD值较高的Y-STR基因座及快速突变基因座可促使更快进入平台期.

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来源
《中国法医学杂志》 |2021年第5期|510-514519|共6页
作者
莫晓婷; 杨成; 吴俞衡; 马温华; 尚蕾; 李万水;
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作者单位

公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心北京 100038;

公安部物证鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室北京 100038;

犯罪现场法医物证技术重庆市重点实验室重庆 400000;

公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心北京 100038;

公安部物证鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室北京 100038;

公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心北京 100038;

公安部物证鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室北京 100038;

公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心北京 100038;

公安部物证鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室北京 100038;

公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心北京 100038;

公安部物证鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室北京 100038;

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正文语种 chi
中图分类法医物证检验学;
关键词
法医遗传; Y-STR; DNA数据库; 数据库模型; Y染色体;

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