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肾脏基因表达数据库的建立与肾脏衰老相关基因表达谱研究

摘要

目的:运用基因芯片技术及公共数据库,首次建立大鼠肾脏基因表达谱数据库,比较成年及老年大鼠肾脏基因表达变化,筛选肾衰老相关基因,方法:将代表8192条基因的PCR产物中CartesianPixsys7500点样仪按微矩阵排列点样于Dako玻璃片,将等量的成年大鼠肾脏组织和衰老大鼠肾组织mRNA分别用cy-3,cy-5逆转录荧光标记,制作cDNA探针,混合后与上述表达谱芯片进行杂文,Scan Array3000扫描仪扫描杂交信号荧光强度,ImaGENE3.0软件分析扫描结果,与公共数据库比较,建立大鼠肾脏表达谱数据库,结果:在进入研究的8192条基因中,1245条基因(1.5%)在衰霉素 大鼠肾脏组织中有表达差异(1.7倍以上),在老年大鼠肾组织中表达增加的基因有71条,其中16条(22.5%为应激反应相关或炎症相关基因,17条(23.9%)为细胞外基质代谢/细胞骨架/肿瘤相关基因,在衰老大鼠肾组织表达下降的基因有53条,其中9条(16.9%)为能量代谢相关基因,12条(22.6%)为蛋白质合成/代谢相关基因,6条(11.3%)为细胞周期/有丝分裂相关基因,4条(7.5%)为DNA/RNA损伤修复基因,3条(5.6%)为离子转运相关基因,结论:肾脏衰老的基因表达特征表现为应激与炎症反应讥进,细胞外基质代谢失调及肿瘤相关基因表达活跃,另一方面,有丝分裂调节下降,DNA/RNA修复能力,蛋白合成及肾脏离子转运能力下降,上述转录水平的变化与衰老肾脏的病理生理特征相符合。

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