绝经后骨质疏松症患者基因表达谱的改变

孙娜; 史传道; 张荣强; 张帆; 李星慧; 张章

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绝经后骨质疏松症患者基因表达谱的改变

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目的利用基因芯片公共数据库中RNA标本芯片数据,分析绝经后骨密度降低程度不同的骨质疏松症患者外周血基因表达谱及分子网络变化.方法从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载美国奥马哈20名绝经后妇女的外周血RNA标本基因芯片数据,利用基因云、基因大数据分析(Gene-Cloud of Biotechnology Informs,GCBI)实验平台、GenClip2.0、Sytoscape 3.5.1等软件,筛选差异表达基因.结果差异基因主要涉及MAPK调节、细胞内信号转导的调控、细胞运动、免疫效应等生物学功能.基因网络中以MAPK3、ARRB2、STK11、USP9X、MYO1C、GTF2H1等基因degee值较大,基因MAPK3、ARRB2、STK11、MYO1C、GTF2H1在不同骨密度人群中表达差异有统计学意义(P＜0.05),其中基因MAPK3、ARRB2、STK11和MYO1C诊断价值有统计学意义(P＜0.05).结论 MAPK3、ARRB2、STK11和MYO1C基因为蛋白网络核心节点.MAKP3和ARRB2基因与骨质疏松的发生关系密切.

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来源
《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 |2018年第4期|369-374|共6页
作者
孙娜; 史传道; 张荣强; 张帆; 李星慧; 张章;
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作者单位

712046 咸阳,陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室;

712046 咸阳,陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室;

712046 咸阳,陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室;

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712046 咸阳,陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室;

712046 咸阳,陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室;

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正文语种 chi
中图分类骨骼疾病;
关键词
骨质疏松; 基因表达; 生物信息学;

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