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石斛碱抗脑缺血再灌注损伤的网络药理学研究

         

摘要

目的基于网络药理学研究石斛碱抗脑缺血再灌注损伤(CIRI)的作用机制。方法通过数据库Pharmmapper、BATMAN-TCM和GeneCards分别对石斛碱及疾病靶点进行预测,利用VENNY2.1.0进行映射得到石斛碱作用于CIRI的潜在靶点,再导入Cytoscape3.8.2软件构建蛋白-蛋白交联互作网络(PPI)。利用R语言的clusterProfiler软件包对石斛碱抗脑缺血再灌注损伤的潜在靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因及基因组百科全书(KEGG)富集通路分析。结果找到石斛碱相关靶点214个,脑缺血再灌注损伤相关靶点513个,交集靶点58个,PPI分析度值排名前10的核心靶基因有ALB、MAPK1、MAPK8、CASP3、IGF1、SRC、NOS3、MMP2、HSP90AA1和ESR1。通过KEGG富集通路分析得到14条显著通路,与相关文献检索报道有关的为Rap1信号通路、MAPK信号通路、趋化因子(chemokine)信号通路等。结论石斛碱通过多靶点、多途径治疗CIRI,其可能主要通过炎症、凋亡等途径起到抗CIRI的作用。

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