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鸡NLRC3分子结构及其在宿主感染后的转录特征研究

         
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为探究鸡核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRC3)的分子特征以及在健康鸡和副鸡禽杆菌(APG)感染鸡中的表达情况,本研究经PCR扩增鸡NLRC3基因,测序后与其他物种的该基因进行相似性分析,构建鸡NLRC3基因进化树,分析其遗传进化关系;通过各种生物信息学软件,分析鸡NLRC3的理化性质、结构域、二级结构和三级结构等。结果显示,鸡NLRC3基因编码区为3282 bp,编码1092个氨基酸;鸡NLRC3与鸿雁等鸟类亲缘关系较近,在进化树中处于同一分支;结构域分析显示,鸡NLRC3由N端的CARD结构域、中央的NBD结构域和C端的14个LRR结构域组成,其二级结构有526个α-螺旋、43个β-转角、66个延伸链、290个无规则卷曲,而其三级结构呈马蹄形。本研究进一步通过荧光定量PCR检测鸡NLRC3基因在健康鸡组织中的分布,随后将APG分别感染鸡及DF-1细胞,通过荧光定量PCR检测鸡NLRC3的转录水平分析鸡NLRC3分子表达特征。结果显示,鸡NLRC3在健康鸡的23个被检组织中广泛分布,其中在空肠中的转录水平最高;APG感染鸡及DF-1细胞后,脾脏、眶下窦和DF-1细胞中NLRC3的转录水平先下调,随后显著上调。上述结果首次表明NLRC3参与鸡抗APG感染的先天免疫应答及免疫调节。本研究为进一步研究鸡NLRC3在抗细菌感染免疫应答机制中的作用奠定了基础。

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