不同遗传背景猪TNF-α基因启动子区多态性与其血清含量的关联分析

LI Meng-shu; SUN Fu-liang; LIU Jian-qian; CAO Yang; LI Zhao-hua; JIN Hai-guo; ZHANG Li-chun

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为研究不同遗传背景猪TNF-α基因启动子区多态性及其与血清含量的相关性,本实验采用克隆测序方法对3个不同遗传背景猪群体(长白山野猪民猪杂交猪,简称野杂猪、民猪和大白猪)TNF-α基因启动子区进行基因多态性检测并测序,选取特定区域采用高分辨率熔解曲线(HRM)方法分析其基因型,并分析了其不同基因型与血清TNF-α含量的相关性.测序结果显示3个群体猪TNF-α基因启动子区存在7个单核苷酸多态位点(SNP).选取其G-1256、G-1239位点区采用HRM分析显示3个猪群体TNF-α基因启动子区存在4种基因型,其中CC基因型作为优势基因型,在野杂猪群体中该基因型频率高达73.0％,民猪次之为52.0％,大白猪最低为31.0％.差异显著性分析显示,野杂猪、大白猪群体中CC基因型个体血清TNF-α含量显著高于其它基因型个体(p＜0.05).将所有猪看做统一群体,差异显著分析显示CC基因型个体血清中TNF-α含量同样显著高于其它基因型个体(p＜0.05).转录因子结合位点预测显示CC基因型G-1239位点A构成NF-κB亚基RelB潜在转录结合位点.上述结果表明NF-κB信号通路在猪TNF-α基因转录表达调节中具有重要作用,本实验为研究影响猪群抗逆表型性状的调控通路奠定基础.

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来源
《中国预防兽医学报》 |2019年第1期|69-73|共5页
作者
LI Meng-shu; SUN Fu-liang; LIU Jian-qian; CAO Yang; LI Zhao-hua; JIN Hai-guo; ZHANG Li-chun;
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作者单位

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正文语种 chi
中图分类家畜免疫学;
关键词
TNF-α基因; 野杂猪; 民猪; 大白猪; 基因多态性;

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