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牛轮状病毒和牛冠状病毒双重TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及应用

         

摘要

为建立一种同时检测牛轮状病毒(BRV)和牛冠状病毒(BCV)的方法,本研究根据GenBank中登录的BRV VP6基因保守序列和BCVN基因保守序列设计引物和探针,通过方阵法优化体系后,建立了一种可以同时检测BRV和BCV的双重TaqMan荧光定量PCR方法.该方法与牛病毒性腹泻病毒、牛细小病毒、牛肠道病毒、牛传染性鼻气管炎病毒均无交叉反应,特异性强;敏感性试验结果显示,该方法对BRV和BCV重组质粒标准品的最低检测限分别为41.8拷贝/μL和3.55拷贝/μL,敏感性高;组内和组间变异系数均小于2%,表明该方法重复性较好.利用建立的该方法对本实验室于2019年3月~9月在河北省内采集的72份牛腹泻粪便样品进行检测,结果显示BRV的阳性率为50.0%(36/72),BCV的阳性率为75.0%(54/72),BRV和BCV共感染率为33.3%(24/72);而常规PCR的上述检测结果分别为47.2%(34/72)、70.8%(51/72),共感染率为29.1%(22/72),二者对BRV和BCV检测结果的阳性符合率分别为97.2%、96.8%,表明该方法可以用于临床样品的检测.本研究建立的双重TaqMan荧光定量PCR方法对BRV和BCV的检测和流行病学调查具有重要意义.

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