首页> 中文期刊> 《中国预防兽医学报》 >猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析

猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析

         

摘要

为了解上海地区猪群中猪星状病毒(PAstV)的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年~2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析.结果 显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PAstV与其他腹泻病病原的混合感染情况较复杂,二重感染率占比达56.93%,主要以PAstV/猪嵴病毒(PKoV)为主(20.07%);三重感染率占比29.41%,以PAstV/PKoV/猪流行性腹泻病毒(PEDV)(10.09%)感染模式为主;四重感染率为11.4%,以PAstV/牛病毒性腹泻病毒(BVDV)/猪札幌病毒(PoSaV)/猪萨佩罗病毒(PSV) (13.51%)感染为主.猪群中PAstV的流行与气温差有很大关系,在季节交替时节流行率较高,特别是秋冬交替时节.选取其中2个PAstV阳性样品(JS-PAstV和CM-PAstV)进行全基因组序列的测定和分析,结果显示两者的全基因组同源性不高,仅为73.8%.全基因组进化分析显示,CM-PAstV分别与挪威、日本、美国的PAstV 3型的亲缘性较近;而JS-PAstV与匈牙利的PAstV 3型的亲缘性最近.对ORF2基因进行病毒重组分析,显示JS-PAstV和CM-PAstV的ORF2基因均与人星状病毒之间存在重组现象.提示,上海地区猪群中存在PAstV 3型的流行,且遗传距离较远,但存在与人星状病毒重组的风险,需进一步监测关注.本研究数据丰富了国内PAstV的流行病学资料,可为该病的风险防控提供科学数据.

著录项

  • 来源
    《中国预防兽医学报》 |2021年第10期|1046-10501073|共6页
  • 作者单位

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室 上海201106;

    上海市种猪工程技术中心 上海201106;

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室 上海201106;

    上海市种猪工程技术中心 上海201106;

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室 上海201106;

    上海市种猪工程技术中心 上海201106;

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室 上海201106;

    上海市种猪工程技术中心 上海201106;

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室 上海201106;

    上海市种猪工程技术中心 上海201106;

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室 上海201106;

    上海市种猪工程技术中心 上海201106;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 家畜病毒学;
  • 关键词

    猪星状病毒; 混合感染; 季节性; 遗传进化分析; 基因序列重组;

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号