α粒子辐射诱发人支气管上皮BEP2D细胞癌变的snoRNA鉴定及靶标预测

岳小乔; 白琛俊; 谢达菲; 刘晓丹; 周平坤

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目的识别鉴定α粒子辐射致人支气管上皮BEP2D细胞癌变中的差异表达核仁小分子RNA（snoRNA）,预测其靶标基因及RNA共表达网络。方法通过全基因组转录组微阵列芯片对人支气管上皮细胞BEP2D及由其衍生的α粒子诱发癌变的BERP35T-4细胞的RNA差异表达谱分析,从中筛选出差异表达的snoRNA,qRT-PCR验证包括其衍生sdRNA在内的表达变化,通过生物信息学分析snoRNA的功能区,预测靶标和共表达网络。结果 qRT-PCR验证结果与芯片结果一致,sno116家族在BERP35T-4中表达下降,是BEP2D的0.105%,差异有统计学意义（t=26.60,P＆0.01）;筛选的sno116-14等在癌变细胞BERP35T-4及人肺癌细胞A549和H1299等中表达量普遍下调,并且还发现sno116-14衍生的sdRNA的表达量在同一细胞中差异显著,建立了sno116家族的mRNA-lncRNA共表达网络,预测靶标有ZNF280D、TFDP1、CCDC28B、RPS6KA3、CANX、RUNX1、KALRN等,功能上与细胞增殖、细胞骨架结构等相关。结论识别鉴定了α粒子辐射致细胞癌变相关差异表达snoRNA,预测sno116-14的靶标基因参与细胞增殖、细胞骨架结构等生物学过程和功能调控信号通路,为C/D box snoRNA发挥功能的作用方式及电离辐射致癌机制提供了新的信息。

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来源
《中华放射医学与防护杂志》 |2020年第6期||共页
作者
岳小乔; 白琛俊; 谢达菲; 刘晓丹; 周平坤;
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作者单位

1. 南华大学公共卫生学院 2. 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所;

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正文语种 chi
中图分类放射病、放射损伤;
关键词
α粒子; 电离辐射; snoRNA; sno116-14; 癌变;

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