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类风湿关节炎患者外周血单个核细胞中环状RNA差异表达分析

         

摘要

目的探讨环状RNA(circRNA)在RA PBMCs表达谱的差异及临床意义。方法收集4例RA患者(T组)及4名健康体检者(C组)静脉血, 运用Arraystar circRNA微阵列芯片检测2组PBMCs中circRNA表达谱, 应用相关数据库进行生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证表达失调circRNA的表达情况, 并对目标circRNA构建circRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)调控网络(即ceRNA网络)。建立受试者工作特征曲线(ROC曲线), 对潜在诊断价值进行分析。采用SPSS Statistics 23.0和Graphpad Prism 8.0分析数据, 采用两独立样本t检验分析2组间差异。结果①微阵列芯片结果显示, 与C组比较, T组PBMCs中异常表达的circRNA共有399个, 其中149个上调, 250个下调。②生物信息学分析:circRNA与miRNA结合位点预测提示RA中差异表达的circRNA可能通过靶向结合miR-140-5p、miR-338-5p和miR-9-5p等分子影响炎症反应;基因本体论分析发现差异表达的circRNA主要在细胞质、蛋白质结合等方面;京都基因与基因组百科全书通路分析发现涉及的通路多与人体免疫调节相关。③多样本RT-qPCR验证结果显示T组中hsacircRNA009012的相对表达量显著高于C组(t=-4.417, P&0.01), hsacircRNA101328的表达水平显著低于C组(t=-1.042, P&0.01), hsacir-cRNA058230的表达无明显改变(t=4.691, P&0.05)。④ ROC曲线分析提示hsacircRNA009012具有诊断RA的潜在价值(ROC曲线下面积=0.96)。结论 circRNA在RA患者PBMCs中表达失调, 可能参与RA发生发展的调控, 其中hsacircRNA009012有望成为RA诊疗的新型生物学标志物。

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