CODEHOP法设计简并引物克隆鲫鱼肌钙蛋白C(TnC)基因及序列分析

卢玉婷; 张雅斌; 王建超; 吉尚雷; 杜晓燕; 张培军; 李月红

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本文结合生物信息学资源和生物软件的使用,针对特定的氨基酸序列设计简并引物,利用CODEHOP法设计简并引物克隆鲫鱼肌钙蛋白C(TnC)基因,并构建系统进化树.证明该基因片段与其他鱼类TnC基因具有较高的同源性,其中与斑马鱼同源性最高达到96％,与大西洋鲑、白斑狗鱼、虹鳟、斜带石斑鱼、斑点叉尾鮰的同源性分别为92％、92％、91％、91％、85％.研究表明,应用此种方法设计出的引物简并度相对较低,Tm值的修改较为灵活,产物特异性强.

著录项

来源
《中国兽医杂志》 |2015年第1期|91-9396|共4页
作者
卢玉婷; 张雅斌; 王建超; 吉尚雷; 杜晓燕; 张培军; 李月红;
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作者单位

吉林农业大学动物科学学院,吉林长春1301 18;

吉林省水产科学研究院,吉林长春130000;

吉林农业大学动物科学学院,吉林长春1301 18;

吉林农业大学动物科学学院,吉林长春1301 18;

吉林省水产科学研究院,吉林长春130000;

吉林省卫生监测检验中心,吉林长春130000;

吉林农业大学动物科学学院,吉林长春1301 18;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类基因工程的应用;水产生物学;
关键词
鲫鱼; 简并引物; CODEHOP; 肌钙蛋白C(TnC);

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