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重庆三峡库区2012年乙脑病毒分离株基因序列分析

         
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目的 通过分析2012年重庆三峡库区蚊虫中分离乙脑病毒株PrM及E基因序列,揭示毒株的遗传特性.方法对新分离乙脑病毒的PrM及E基因进行PCR扩增,将扩增产物测序.用分子生物学软件进行核苷酸及氨基酸序列分析,并绘制系统进化树.结果 新分离的8株乙脑病毒株均为基因Ⅰ型,与我国其他省市的既往分离株进化关系较近;分离株与减毒活疫苗株SA14-14-2相比较,PrM区核苷酸同源性在85.1％～86.7％之间,氨基酸同源性在95.1％～96.3％之间;E基因区核苷酸同源性在87.6％～87.8％之间,氨基酸同源性在96.9％～97.1％之间.所有新分离株与疫苗株在E基因存在14个氨基酸差异位点.结论 2012年8株重庆乙脑分离株为基因Ⅰ型,在E基因区域与疫苗株相比有部分差异.

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