基于MATLAB的隐马尔可夫模型识别CpG岛

石鸥燕; 杨晶; 田心

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基于MATLAB的隐马尔可夫模型识别CpG岛

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随着多数生物基因组测序工作的完成,基因识别就显得尤为重要.CpG岛在基因组中有着重要的生物学意义,而识别CpG岛将有助于基因的识别.因此构建了识别DNA序列中CpG岛的隐马尔可夫模型HMM(Hidden Markov Model),并利用网上人类基因CpG岛数据库中随机选取的94条基因序列数据对该模型进行训练与检测,得到了很高的预测准确率,结果表明HMM用于CpG岛的识别是快速有效的.

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来源
《计算机应用与软件》 |2008年第11期|214-215231|共3页
作者
石鸥燕; 杨晶; 田心;
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作者单位

天津医科大学生物医学工程系;

天津;

300070;

天津医科大学生物医学工程系;

天津;

300070;

天津医科大学生物医学工程系;

天津;

300070;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类计算技术、计算机技术;
关键词
马尔可夫链; 隐马尔可夫模型; CpG岛; MATLAB;

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