一种应用于单细胞RNA测序数据的稀有类型细胞检测算法

马安琪

首页> 中文期刊> 《计算机应用与软件》 >一种应用于单细胞RNA测序数据的稀有类型细胞检测算法

一种应用于单细胞RNA测序数据的稀有类型细胞检测算法

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

与批量RN A测序数据相比,单细胞RN A测序数据提供了单个细胞层面粒度的信息,能够揭示细胞之间的异质性.稀有类型细胞检测作为其重要的数据下游分析之一,具有显著的生物意义.针对现有算法时间复杂度高、精确度较低等问题,提出一种新的稀有类型细胞检测算法.该算法通过多轮快速随机划分,对每个细胞的稀有程度进行打分,然后将结果基于最近邻算法进行调整,最终预测出稀有类型细胞.在有标签的单细胞RN A测序数据集上的结果表明,与其他方法相比,该算法能够更有效地检测出稀有类型细胞.

著录项

来源
《计算机应用与软件》 |2021年第10期|316-320|共5页
作者
马安琪;
展开▼
作者单位

复旦大学计算机科学技术学院智能信息处理重点实验室上海200433;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类计算技术、计算机技术;
关键词
单细胞RNA测序; 稀有类型细胞检测; 随机算法;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 基于单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类算法 [J] . 何睿 ,余娜 ,李淼 . 智能计算机与应用 . 2020,第007期
2. 基于单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类算法 [J] . 何睿 ,余娜 ,李淼 . 智能计算机与应用 . 2020,第007期
3. 肺癌恶性胸腔积液中稀有肿瘤细胞的鉴定与单细胞测序分析 [J] . 吴保军 ,王卓 ,董宇 . 遗传 . 2019,第002期
4. 单细胞RNA测序数据分析方法研究进展 [J] . 张淼 ,孙祥瑞 ,徐春明 . 生物技术通报 . 2021,第001期
5. 基于DAE的单细胞RNA测序数据聚类研究 [J] . 何慧茹 ,李晓峰 ,张鑫 . 现代电子技术 . 2020,第024期
6. 通过单细胞群测序技术鉴定卵丘颗粒细胞亚群的基础研究 [C] . 杨富 . 第四届华夏医学妇产科论坛、多学科协作妇产国际论坛、第三届华夏医学妇产科青年医师论坛 . 2018
7. 一种无扩增偏差的单细胞总RNA链特异性全长转录本及单细胞small RMA-mRNA双转录组测序方法的建立 [A] . 程果 . 2020

一种应用于单细胞RNA测序数据的稀有类型细胞检测算法

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅