使用角色反演句法分析器RNA二级结构的预测

党琰; 张宇镭; 张冬茉; 赵立平

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使用角色反演句法分析器RNA二级结构的预测

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RNA二级结构预测问题是生物信息学的一个研究重点.该文主要利用自然语言理解中句法分析的方法来研究RNA二级结构预测.使用基于角色反演算法建立起来的,采用概率上下文无关文法进行分析的句法分析器,来预测RNA二级结构.结合传统Chart算法分析器和广义LR算法分析器的优点,建立角色反演句法分析器;根据RNA二级结构的构建方法建立相应的概率上下文无关文法;给出对RNA二级结构进行预测的具体实例.

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来源
《计算机工程》 |2006年第8期|207-209|共3页
作者
党琰; 张宇镭; 张冬茉; 赵立平;
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作者单位

上海交通大学计算机科学与工程系;

上海;

200240;

上海交通大学生命科学与技术学院;

上海;

200240;

上海交通大学计算机科学与工程系;

上海;

200240;

上海交通大学生命科学与技术学院;

上海;

200240;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类信息处理（信息加工）;
关键词
RNA二级结构预测; 句法分析; 角色反演算法; 概率上下文无关文法;

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