猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究

郑亚洲; 王国平; 周菊芳; 朱晨熹; 王利平; 徐文兴; 洪霓

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猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究

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为明确猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,Ac VA)和猕猴桃病毒B(Actinidia virus B,Ac VB)在中国猕猴桃(Actinidia sp.)上的侵染状况和分子特性,采用RT-PCR技术对151份猕猴桃样品的Ac VA和Ac VB进行检测,检出率分别为15.2%和17.9%,所收集的6种猕猴桃样品中均检测到一种或两种病毒。发现Ac VA的ORF1、ORF4和ORF5扩增片段序列存在较大分子变异,不同分离物的269 bp片段(ORF1)核苷酸序列相似性为77.3%~99.3%。在基于各扩增片段核苷酸序列的系统进化树中,Ac VA分离物聚为2~3组。采用引物Ac VB5F/5R扩增获得20个Ac VB分离物的342 bp或338 bp的ORF5片段,核苷酸序列相似性为81%~100%,与新西兰Ac VB分离物TP7-93B相应片段的核苷酸序列相似性为83.9%~99.7%,在系统进化树中聚为3组。

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来源
《园艺学报》 |2015年第4期|665-671|共7页
作者
郑亚洲; 王国平; 周菊芳; 朱晨熹; 王利平; 徐文兴; 洪霓;
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作者单位

华中农业大学植物科技学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室;

武汉430070;

农业微生物学国家重点实验室;

武汉430070;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类病害;
关键词
猕猴桃; 猕猴桃病毒A; 猕猴桃病毒B; RT-PCR; 序列分析;

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