基于KEGG通路和蛋白互作对慢性心力衰竭靶点基因的筛选

张永健; 王永成; 杨金龙; 周国锋; 陈纪烨; 迟辰昱; 韩晓伟; 李晓

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基于KEGG通路和蛋白互作对慢性心力衰竭靶点基因的筛选

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目的:运用KEGG通路和蛋白互作筛选出慢性心力衰竭(CHF)靶点基因。方法:以“chronic heart failure”为关键词在NCBI数据库中检索CHF相关靶点基因,并运用R语言相关数据包进行KEGG通路分析,获得CHF的关键通路。对关键通路分析,筛选出CHF相关靶点基因和关键靶点基因。结果:在NCBI数据库检索到CHF相关靶点基因119个,获得关键通路后分析获得9个CHF靶点基因,为IL10,IL6,NOS3,TNF,VCAM1,AGT,EDN1,IFNG,IL17A,5个CHF关键靶点基因,分别为IL6,NOS3,TNF,VCAM1,IL10。结论:运用KEGG通路和蛋白互作筛选出CHF关键靶点基因,为进一步研究CHF的分子机制以及新药的开发奠定了基础。

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来源
《临床心血管病杂志》 |2020年第4期|355-362|共8页
作者
张永健; 王永成; 杨金龙; 周国锋; 陈纪烨; 迟辰昱; 韩晓伟; 李晓;
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作者单位

山东中医药大学;

济南250014;

山东中医药大学附属医院;

济南250011;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类血液循环衰竭;
关键词
信号通路; 蛋白互作; 慢性心力衰竭; 靶点蛋白;

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