长白县黑线姬鼠携带汉坦病毒的S基因特征研究

燕清丽; 杨鹏飞; 邵丽筠; 刘勇先; 浦昀; 张晓龙; 曹晓梅; 郭天宇; 姚李四

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长白县黑线姬鼠携带汉坦病毒的S基因特征研究

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为了解长白县黑线姬鼠中汉坦病毒流行情况及病毒型别,采用巢式RT-PCR方法筛查鼠肺RNA,并对PCR阳性样本进行全S基因的扩增、克隆及测序;构建系统发生树并进行分子进化分析。结果显示:共捕获黑线姬鼠58只,共检测出4份阳性标本,阳性率6.90%。经过序列测定及进化分析显示黑线姬鼠所携带的病毒与汉滩病毒第6基因亚型标准株核苷酸的同源性为95.8%～96.3%,氨基酸同源性为98.6%～99.5%。同时发现,长白县黑线姬鼠携带的汉滩病毒的NP蛋白共有1个特异性氨基酸位点为S387。

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来源
《病毒学报》 |2013年第4期|382-385|共4页
作者
燕清丽; 杨鹏飞; 邵丽筠; 刘勇先; 浦昀; 张晓龙; 曹晓梅; 郭天宇; 姚李四;
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作者单位

中国检验检疫科学研究院卫生检疫研究所;

北京100123;

吉林出入境检验检疫局;

长春130062;

长白出入境检验检疫局;

长白134400;

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正文语种 chi
中图分类家畜病毒学;
关键词
汉滩病毒; RT—PCR; 系统进化; 基因分型;

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