湿疹患儿肠道菌群高通量测序初步探索

王和平; 王玉蕾; 郑跃杰; 李萍; 邓继岿

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湿疹患儿肠道菌群高通量测序初步探索

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目的为了解湿疹患儿肠道菌群的结构与湿疹之间的关系,通过对湿疹患儿和健康儿童粪便样本细菌总DNA提取,利用高通量测序技术,比较健康儿童和湿疹患儿肠道菌群的异同。方法 10例年龄在2个月-2岁婴幼儿由皮肤科门诊确诊为湿疹伴有过敏性疾病家族史作为研究对象,年龄和性别相当健康儿童10例作为对照,分别收集其粪便标本并提取所有样本中细菌的总DNA,对16SrRNA基因进行高通量测序,获得两组的肠道菌群结构数据并进行菌群差异性分析。结果通过Roche 454高通量测序,两组肠道微生物菌群多样性指数比较差异无统计学意义。两组主要由Firmicutes（厚壁菌门）、Bacteroidetes（拟杆菌门）、Proteobacteria（变形菌门）和Actinobacteria（放线菌门）4个门组成;两组在门水平上进行菌群结构比较,差异无统计学意义。两组样本在属水平上共获得200个不同属的细菌,其中Bacillus（芽孢杆菌属）、Bilophila（噬胆菌属）、Christensenella（纺锤状细菌属）、Coprobacillus、Eikenella（艾肯菌属）、Enterobacter（肠杆菌属）、Eubacterium（真杆菌属）、Lactococcus（乳球菌属）、Megamonas（巨单胞菌属）、Leuconostoc（明串珠菌属）、Morganella（摩根菌属）、Rhizobacter（根杆菌属）、Proteus（变形菌属）、Sutterella（萨特菌属）、Veillonella（韦荣球菌属）、Akkermansia、Anaeroglobus、Anaerotruncus、Butyricicoccus、Epulopiscium、Gordonibacter、Lachnospiraceae uncultured、Robinsoniella和Varibaculum共24个属在两组间差异具有统计学意义。结论湿疹患儿肠道菌群与健康儿童相比,菌群多样性指数（Shannon指数和Simpson指数）未见明显差异,但在菌群结构上发生了一些变化,某些特别的细菌菌属存在显著性差异。

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来源
《中国微生态学杂志》 |2016年第7期|751-755|共5页
作者
王和平; 王玉蕾; 郑跃杰; 李萍; 邓继岿;
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作者单位

深圳市儿童医院;

广东深圳518038;

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正文语种 chi
中图分类湿疹;
关键词
肠道菌群; 儿童湿疹; 菌群结构; 高通量测序;

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