副猪嗜血杆菌广东分离株外膜蛋白P5基因的克隆及蛋白结构预测

陈善真; 王贵平; 曾振灵; 李春玲; 贾爱卿; 杨冬霞

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根据GenBank上发表的副猪嗜血杆菌(HPS)外膜蛋白基因的核苷酸序列设计并合成1对特异性引物,从广东省HPS分离株外膜蛋白P5基因中扩增出与预期设计的1116bp大小相符的片段,将扩增产物连接到pMD18-T载体上,进行序列测定和分析。结果表明,克隆出HPS广东分离株的目的基因,核苷酸长为1116bp,共编码371个氨基酸,与已发表的HPS(SH0165)外膜蛋白基因核苷酸序列同源性100%,氨基酸同源性100%。生物学预测分析结果显示,HPS外膜蛋白是一种混合型结构蛋白,含有α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲,其β-转角和无规则卷曲区域可能形成抗原表位;其N端含有1个信号肽,最佳切割位点在21～22个氨基酸;有15个抗原决定簇;无跨膜区;同源建模分析,未见相似三维结构。

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来源
《中国兽医学报》 |2010年第2期|206-210|共5页
作者
陈善真; 王贵平; 曾振灵; 李春玲; 贾爱卿; 杨冬霞;
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作者单位

广东省农业科学院兽医研究所广东省兽医公共卫生公共实验室;

广东广州510640;

华南农业大学兽医学院;

广东广州510642;

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正文语种 chi
中图分类病原细菌;
关键词
副猪嗜血杆菌; 外膜蛋白P5基因; 基因克隆; 蛋白结构预测;

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