T3基因型柑橘衰退病毒实时荧光定量RT-PCR检测体系的建立及应用

陶珍珍; 李中安; 贾敏; 唐萌; 唐科志; 周常勇; 周彦

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根据不同基因型柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)ORF1a的序列差异,设计T3基因型CTV的特异性引物T3-4F/R,通过优化得到最佳反应条件建立T3基因型CTV分离株的SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR,并进行灵敏性、重复性试验。应用该方法测定柑橘植株中T3基因型CTV分离株含量。建立了一种特异性检测T3基因型CTV分离株的SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法,其灵敏性比普通RT-PCR方法高100倍。标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,扩增效率为97.1%,相关性系数为0.992。组内和组间变异系数均小于2.94%,表明该方法重复性好。田间样品中T3基因型CTV含量差异较大,最高含量是最低含量的1 250倍。本研究中建立的实时荧光定量RT-PCR检测方法能够准确检测柑橘植株内的T3基因型CTV分离株,可用于研究T3基因型的CTV的变化规律。

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来源
《园艺学报》 |2015年第1期|183-190|共8页
作者
陶珍珍; 李中安; 贾敏; 唐萌; 唐科志; 周常勇; 周彦;
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作者单位

西南大学植物保护学院;

重庆400715;

中国农业科学院柑桔研究所;

重庆400712;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类柑桔类病虫害;
关键词
柑橘衰退病毒; T3基因型; 实时荧光定量RT-PCR;

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