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感染性病原体二代测序技术研究进展

         

摘要

感染性疾病是全球人口发病及死亡的主要原因,病原学快速精准鉴定是其控制、预防的基础。传统病原学检测技术成熟、阳性预测价值高,然而却面临着病原谱窄、阳性率低、精确度低、检测周期长等局限性,常导致疾病治疗延误及抗菌药物滥用。二代测序技术(NGS)以其高通量、覆盖度广、精确度高等优势,成功应用于疑难危重感染性疾病诊治以及未知病原体鉴定、耐药基因监测、流行病学追踪调查等方面。NGS作为病原学鉴定的一种新技术,表现出巨大潜力,然而目前临床感染工作者认知及接受程度各异,本文通过综述NGS的基本原理、发展历程以及在感染性疾病病原体鉴定中的典型案例及其优势,反思其技术尚存在的挑战,使广大医疗工作者充分了解NGS作为感染性疾病诊断工具的作用及其局限性;同时提出NGS未来技术的发展方向,以期在感染性疾病的诊治中发挥更大的优势。

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