新疆维吾尔族慢性乙型肝炎患者HBV基因型及亚型分析

聂晶晶; 闫玲; 李卓; 希尔娜依.阿不都黑力力; 金晖; 孙奎霞; 李杰; 庄辉

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目的探讨新疆维吾尔族(维族)慢性乙型肝炎患者中乙型肝炎病毒(HBV)基因型及基因亚型。方法用本实验室建立的HBV基因型及基因亚型特异性引物巢式聚合酶链反应(nPCR)法,对54份新疆维族慢性乙型肝炎患者血清样本进行HBV基因型及亚型分析。随机选取11株经nPCR法鉴定为D基因型的样本,同时进行PreS/S区及PreC/C区测序以鉴定D基因亚型。随机选取2株D型HBV进行基因组全长扩增并克隆测序。从GenBank下载75株各国HBVD1亚型参考序列,根据Kimuratwo-parameter法计算中国新疆地区与其他国家的HBVD1亚型株进化距离。结果新疆维族人群HBV感染以D基因型为主,占66.67%,同时存在B(5.56%)、C(5.56%)基因型及混合感染(22.22%)。新疆存在D1和D3两种亚型,以D1亚型为主。新疆D1亚型与中亚哈萨克斯坦、乌兹别克斯坦、蒙古等国及中东地区土耳其、伊朗、埃及等国的进化距离较近。结论新疆维族慢性乙肝患者中D基因型为优势株,主要为D1亚型,其进化距离与中亚中东等国较为接近。

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来源
《中国预防医学杂志》 |2010年第7期|649-654|共6页
作者
聂晶晶; 闫玲; 李卓; 希尔娜依.阿不都黑力力; 金晖; 孙奎霞; 李杰; 庄辉;
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作者单位

北京大学医学部病原生物学系;

北京100191;

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正文语种 chi
中图分类 R512.62;
关键词
乙型肝炎病毒; 基因型; 基因亚型; 基因组;

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