布鲁菌外膜蛋白基因Omp22克隆测序及生物信息学分析

李向阳

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布鲁菌外膜蛋白基因Omp22克隆测序及生物信息学分析

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根据GenBank中的布鲁菌属特异性基因序列Omp22设计1对引物,以牛布鲁菌(Brucella)通辽市分离菌株染色体DNA作为模板,进行PCR扩增。将其定向插入克隆载体PGEM-7Zf,综合利用生物信息学软件(Danman和Vector NTI)、数据库(Prosite和PDB)和网络服务器对外膜蛋白Omp22进行基本性质分析、三维结构预测和功能预测。结果显示,用PCR方法扩增的Omp22基因长度为639bp,编码212个氨基酸,预测其蛋白质的相对分子质量约为22 000,同时用于预测B细胞线性表位的柔韧性和亲水性参数得到综合阐释,生物信息学预测和分析结果可为研究在布氏菌致病及机体免疫应答中外膜蛋白Omp22的结构与功能的关系提供丰富资料。

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来源
《中国兽医学报》 |2012年第5期|670-674|共5页
作者
李向阳;
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作者单位

内蒙古民族大学成人教育学院;

内蒙古通辽028043;

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正文语种 chi
中图分类病原细菌;
关键词
布鲁菌; Omp22基因; 克隆; 序列测定; 生物信息学分析;

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