黄瓜绿斑驳花叶病毒辽宁分离物全基因组序列测定

陈红运; 林石明; 陈青; 赵文军; 廖富荣; 陈洪俊; 朱水芳

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黄瓜绿斑驳花叶病毒辽宁分离物全基因组序列测定

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以感病组织总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增并测定黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)辽宁分离物(CGMMV-LN)的基因组全序列。CGMMV-LN基因组全长6 422 nt,5'非编码区(noncoding region,NCR)和3'NCR分别为59 nt和175 nt。CGMMV-LN编码的4个蛋白依次是186 kD和129kD的复制酶,29 kD的移动蛋白和17.4 kD的外壳蛋白。CGMMV-LN与其他4个CGMMV分离物基因组核苷酸序列同源性为97.6%～99.3%,与同属其他3种病毒基因组核苷酸序列同源性仅为61.7%～62.8%。基于186kD复制酶和外壳蛋白氨基酸序列的同源树显示:侵染葫芦科作物的烟草花叶病毒属病毒可分为2个亚组,亚组I包括所有CGMMV分离物,亚组II包括Kyuri绿斑驳花叶病毒(Kyuri green mottle mosaic virus,KGMMV)、黄瓜果实斑驳花叶病毒(Cucumber fruit mottle mosaic virus,CFMMV)和小西葫芦绿斑驳花叶病毒(Zucchini greenmottle mosaic virus,ZGMMV)。

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来源
《病毒学报》 |2009年第1期|68-72|共5页
作者
陈红运; 林石明; 陈青; 赵文军; 廖富荣; 陈洪俊; 朱水芳;
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作者单位

厦门出入境检验检疫局;

厦门361012;

中国检验检疫科学研究院;

北京100029;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类侵（传）染性病害;
关键词
黄瓜绿斑驳花叶病毒; 烟草花叶病毒属; 序列分析;

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