基于失巢凋亡相关lncRNA建立胶质母细胞瘤预后风险评估模型及验证

王天强; 王雨亭; 季泰令

首页> 中文期刊> 《中国优生与遗传杂志》 >基于失巢凋亡相关lncRNA建立胶质母细胞瘤预后风险评估模型及验证

基于失巢凋亡相关lncRNA建立胶质母细胞瘤预后风险评估模型及验证

开具论文收录证明 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

目的探讨失巢凋亡相关长链非编码RNA(lncRNA)的表达量与胶质母细胞瘤(GBM)预后的关系,并构建GBM预后风险模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索GBM样本的RNA-seq与临床数据,从GeneCards与Harmonizome数据库中获取关于失巢凋亡的基因,应用差异分析及相关性分析筛选与失巢凋亡相关的lncRNA,进一步行单因素Cox分析、LASSO回归和多因素Cox分析筛选有与临床相关的lncRNA并构建预后模型,通过K-M分析与受试者操作特征(ROC)曲线验证该模型的准确性;通过公式计算该模型的风险评分,并与临床信息相关联,使用单因素及多因素Cox分析检验其是否为独立的预后因素;对高低风险组进行基因集富集分析(GSEA)与免疫细胞浸润分析。结果分析出1790个失巢凋亡相关的lncRNA;通过分析共筛选得到11个lncRNA,并构建GBM预后模型;基于该风险模型进行K-M分析显示,三个集合中高风险组的总生存期均少于低风险组;其1年、2年、3年的曲线下面积值均大>0.8。结合临床信息分析表明,年龄与风险评分是独立预后因素;绘制Nomogram图,校准曲线表明预测生存率与实际生存率大致相同。在高风险组中,巨噬细胞M0、中性粒细胞明显增加(P<0.05),然而巨噬细胞M1在低风险组中明显增加(P<0.05)。高风险组肿瘤突变负荷水平明显升高。结论通过生物信息学方法筛选出11个影响GBM预后的失巢凋亡相关lncRNA,可能为GBM的预后提供分子生物标志物和治疗靶点,且建立的预测模型预测效能好,准确性高。

著录项

来源
《中国优生与遗传杂志》 |2023年第8期|1557-1564|共8页
作者
王天强; 王雨亭; 季泰令;
展开▼
作者单位

潍坊医学院附属医院浮烟山院区脑系科;

山东潍坊261000;

天津医科大学基础医学院生物信息学系;

天津300070;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类神经系肿瘤;
关键词
胶质母细胞瘤; 失巢凋亡; 长链非编码RNA; 预后预测模型; 生物信息学;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 基于TCGA数据的膀胱癌坏死性凋亡相关lncRNA预后模型的建立与验证 [J] . 彭克楠 ,宁静源 ,谭鹤 . 标记免疫分析与临床 . 2022,第11期
2. 基于自噬相关lncRNA建立子宫颈癌预后风险评估模型 [J] . 刘兴华 ,林泳煌 ,陈东宇 . 实用肿瘤杂志 . 2022,第6期
3. 胶质母细胞瘤预后预测lncRNA模型的建立及验证 [J] . 杜宝顺 ,王运刚 ,尚飞 . 肿瘤基础与临床 . 2021,第4期
4. 基于Hela细胞的失巢凋亡现象时序评价模型的建立及测量验证方法研究 [J] . 薛志超 ,曾嘉明 ,龚晓云 . 计量学报 . 2023,第10期
5. 结肠癌坏死性凋亡相关LncRNA预后模型的建立与评估 [J] . 葛晓阳 ,梅璐 ,郑权 . 河南医学研究 . 2023,第1期
6. 抑制CD24分子对卵巢癌“失巢凋亡”影响的实验研究 [C] . 王丽丽 ,涂松 ,刘玉敏 . 《中医杂志》特邀心血管专家学术座谈会暨中医治疗冠心病心绞痛疾病临床经验会议 . 2017
7. 基于生物信息学筛选胶质母细胞瘤铜死亡相关的LncRNA及预后风险模型的构建 [A] . 曾双权 . 2022

基于失巢凋亡相关lncRNA建立胶质母细胞瘤预后风险评估模型及验证

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅