湖北株H3N8亚型马流感病毒HA基因的序列测定及其HA蛋白遗传特性分析

黄文强; 郭巍; 赵立平; 盛名巍; 王宇; 李红梅; 相文华

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2008年从湖北省分离到1株H3N8亚型马流感病毒A/equine/Hubei/6/08。以2002年美国KENTUKY株为模板设计HA基因测序引物,进行RT-PCR,然后测定该分离株的HA基因核苷酸序列。经NCBI上Blast同源性比较发现,与A/equine/Newmarket/5/2003(H3N8)同源性较高为98.7%。HA蛋白遗传进化分析表明该毒株隶属于H3N8亚型马流感病毒中的美洲系福罗里达亚系。该株与OIE现在推荐的疫苗候选株A/equine/Kentuck-y/5/2002(H3N8)HA1蛋白氨基酸序列比对发现有3处氨基酸替换位点;与OIE以往推荐的疫苗候选株A/e-quine/Kentucky/1/1994(H3N8)比对发现有11处氨基酸替换位点。研究结果表明该分离株可作为中国研制马流感疫苗的候选株。

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来源
《中国兽医学报》 |2010年第5期|612-614|共4页
作者
黄文强; 郭巍; 赵立平; 盛名巍; 王宇; 李红梅; 相文华;
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作者单位

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室;

黑龙江哈尔滨150001;

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正文语种 chi
中图分类 S852.652;
关键词
H3N8亚型马流感病毒; HA基因; 马流感疫苗;

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