临床宏基因组学应用现状及存在问题分析

邱薇; 钟民涛; 伦永志

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临床宏基因组学应用现状及存在问题分析

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众所周知,宏基因组学是一种通过提取样品中微生物的总DNA,构建宏基因组文库,研究环境中全部微生物的遗传组成及其菌落功能的方法。而宏基因组新一代测序(metagenome next-generation sequencing, mNGS)是在宏基因组学基础上进一步发展起来的新一代测序技术,无需对患者标本进行培养,直接分析标本中的微生物DNA或RNA。本文介绍了宏基因组学在临床上的应用,包括传染病的诊断、疾病和健康状态下的微生物组分析、人类宿主反应分析和肿瘤相关病毒及其基因组鉴定,并简要探讨了临床宏基因组学研究中所遇到的挑战及解决方法。

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来源
《中国微生态学杂志》 |2021年第5期|594-598|共5页
作者
邱薇; 钟民涛; 伦永志;
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作者单位

莆田学院药学与医学技术学院医学微生态学福建省高校重点实验室;

福建莆田351100;

大连医科大学基础医学院微生物学教研室;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类病原微生物分类与鉴定;
关键词
临床微生物学; 宏基因组学; 传染病诊断; 生物信息学;

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