捻转血矛线虫丙硫咪唑耐药株和敏感株转录组水平下差异基因分析

石雅琴; 苏倩; 王腾宇; 毛晓伟; 陈昕迪; 穆嘉明; 王文龙; 刘春霞

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首先筛选捻转血矛线虫丙硫咪唑敏感株和耐药株单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)信息,然后从比较转录组测序数据中筛选出4个丙硫咪唑耐药相关突变基因HCON_00192020、HCON_00037800、HCON_00129090和HCON_00178650,并进行生物信息学分析,最后对差异基因进行PCR扩增并测序。结果显示,共筛选到41个具有SNP位点的基因,选择reads≥10的4个基因进行后续基因扩增和生物信息学分析。扩增后目的条带大小均正确,测序后显示HCON_00192020基因在3个耐药虫株中第266位均由T突变为C,HCON_00037800基因在3个耐药虫株中第179、182、188位均由A突变为G,HCON_00129090基因在3个耐药虫株中第283位由G突变为A,HCON00178650基因在3个耐药虫株中第89位均由C突变为A,突变结果均与转录组测序结果一致。

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来源
《中国兽医学报》 |2021年第7期|1295-1300|共6页
作者
石雅琴; 苏倩; 王腾宇; 毛晓伟; 陈昕迪; 穆嘉明; 王文龙; 刘春霞;
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作者单位

内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室;

内蒙古呼和浩特010018;

内蒙古农业大学生命科学院;

内蒙古呼和浩特010018;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类家畜寄生虫学;
关键词
捻转血矛线虫; 丙硫咪唑; 耐药性; 单核苷酸多态性;

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