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mNGS检测革兰阳性菌耐药基因的临床应用

         
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目的 探讨宏基因组高通量测序（mNGS）检测革兰阳性菌耐药基因的临床应用。方法 收集2021年4月1日-2022年4月1日南京医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科收治的249例呼吸道感染患者肺泡灌洗液标本微生物培养和mNGS检测结果，并进行革兰阳性菌耐药表型和抗菌药物耐药基因（ARGs）分析。结果 249份肺泡灌洗液标本通过mNGS检测到10种革兰阳性菌，以肺炎链球菌、假肺炎链球菌和金黄色葡萄球菌为主；检出携带ARGs的革兰阳性菌4种，金黄色葡萄球菌ARGs有blaZ、mecA、mecR1、aac（6′）-Ie-aph（2′′）-Ia、ant（9）-Ia、tet（K）、tet（L）;粪肠球菌ARGs有tet（M）、dfr（E）;屎肠球菌ARGs有tet（M）;肺炎链球菌ARGs有tet（M）。在3株携带ARGs的金黄色葡萄球菌中，青霉素耐药基因blaZ、甲氧西林耐药基因mecA、氨基糖苷类抗生素耐药基因aac（6′）-Ie-aph（2′′）-Ia可较好地预测耐药表型，四环素耐药基因tet（L）预测的耐药表型与传统药敏培养结果一致性较差。结论 mNGS可检测出革兰阳性菌中ARGs,主要检出ARGs的革兰阳性菌有金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、屎肠球菌和粪肠球菌；金黄色葡萄球菌中检测到的耐药基因blaZ、mecA、aac（6′）-Ie-aph（2′′）-Ia可较好地预测耐药表型。mNGS检测ARGs预测耐药表型有一定临床应用价值。

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