基于生物信息学构建上皮性卵巢癌组织中miRNA-mRNA调控网络

田春艳; 邱娜; 唐义玲; 周义文; 王亮

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基于生物信息学构建上皮性卵巢癌组织中miRNA-mRNA调控网络

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目的通过生物信息学构建上皮性卵巢(EOC)组织中miRNA-mRNA调控网络,以期为卵巢癌机制学研究提供研究思路。方法选择GEO数据库中关于上皮性卵巢癌细胞外泌体及裂解物差异表达miRNA数据集GSE197892,选取其交集miRNA及各自表达显著的miRNA作为研究对象。应用在线分析网站预测其靶基因,并对其进行生物信息学分析,同时构建miRNA-mRNA调控网络。结果外泌体组共筛选出的差异表达miRNA共30个,裂解物组共有32个,两组交集miRNA共有3个。外泌体组可筛选出3个显著差异表达miRNA,裂解物组则有4个。生物信息学分析显示,三组靶基因均于癌症通路中富集程度最高;同时,交集组靶基因于PTEN/Akt、FoxO等信号通路中显著富集;外泌体组靶基因于Hippo、Wnt等信号通路中显著富集;裂解物组靶基因则还显著富集于mTOR、MAPK等信号通路中。调控网络显示外泌体组、裂解物组、交集miRNA及其靶基因之间均有联系,多个靶基因可受多个miRNA的共同调控;同时,miR-214-3p及其靶基因FAT4、TMX4、SEMA4D、IGSF3及RRP7A处于调控网络的核心位置。结论筛选出的miRNA及其核心基因可能成为上皮性卵巢癌预测及治疗的潜在靶点。

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来源
《中国优生与遗传杂志》 |2022年第10期|1731-1735|共5页
作者
田春艳; 邱娜; 唐义玲; 周义文; 王亮;
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作者单位

电子科技大学医学院附属绵阳医院;

绵阳市中心医院妇产科;

四川绵阳621000;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类卵巢肿瘤;生物信息论;
关键词
生物信息学; 上皮性卵巢癌; miRNA; mRNA;

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