基于铜死亡相关基因的肾透明细胞癌中预后模型的构建与应用

张保朝; 丁梦; 纪长威; 张青; 郭宏骞

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基于铜死亡相关基因的肾透明细胞癌中预后模型的构建与应用

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目的:研究铜死亡相关基因(cuproposis-related genes,CRGs)在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)中的表达情况,构建预后模型并探讨其临床意义。方法:从TCGA数据库中获得522例ccRCC患者的转录组数据和临床病理数据。将患者随机分为训练集(262例)和验证集1(260例),并将总体患者作为验证集2(522例)。在训练集中采用差异性分析确定肿瘤组织和癌旁组织差异性表达的CRGs,使用LASSO-Cox回归分析构建ccRCC的CRGs预后模型(OSCRG)。根据OSCRG将患者分为低危组和高危组,使用Kaplan-Meier生存分析研究OSCRG与总体生存期(overall survival,OS)的关系。使用单因素和多因素Cox回归分析构建包含OSCRG和临床病理参数的列线图预测OS,并在验证集中验证该列线图的准确性。最后使用KEGG和GO基因富集分析探索差异性表达的CRGs的生物学功能。结果:在训练集中有9个差异性表达的CRGs,并且均与OS相关。LASSO-Cox回归分析确定了3个CRGs并构建OSCRG。使用OSCRG将患者分为高危组和低危组,生存分析显示在训练集和验证集中低危组OS均高于高危组,并且OSCRG是OS的独立预后因素。使用OSCRG和临床病理参数构建的列线图对OS具有良好的预测作用,且加入VHL表达量后其预测能力增强。此外,在训练集和验证集中,高危组术后接受辅助治疗的患者多于低危组。最后,GO和KEGG分析结果表明,差异性表达的CRGs与代谢相关。结论:3种CRGs可能是ccRCC的预后分子标志物,有望为患者的个体化治疗提供新的参考依据。

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来源
《临床泌尿外科杂志》 |2023年第12期|934-941|共8页
作者
张保朝; 丁梦; 纪长威; 张青; 郭宏骞;
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作者单位

南京大学医学院附属鼓楼医院泌尿外科;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类肾、肾盂肿瘤;
关键词
肾细胞癌; 肾透明细胞癌; 铜死亡; 预后模型;

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