2003-2007年中国风疹病毒基因特征分析

朱贞; 许文波; 毛乃颖; 蒋小泓; 许松涛; 何吉兰; 孙莉; 凌华; 张珍英; 李聪勇; 巴卓玛; 詹军; 陈慧; 王飞霞; 周淑洁; 陈霞; 郑蕾; 戴德芳; 张红; 梁勇

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2003-2007年中国风疹病毒基因特征分析

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本研究用Vero细胞或Vero/SLAM细胞从我国10个省(直辖市、自治区,下同)2003～2007年风疹暴发和散发病例的咽拭子标本中分离到57株风疹病毒,用RT-PCR方法扩增了57株风疹病毒E1基因1107个核苷酸的片段,并对该PCR产物进行序列测定和分析。结果提示,在基于WHO基因定型靶序列739个核苷酸片段构建的基因亲缘关系树上,其中55株风疹病毒株属于1E基因型,相对于其他国家的1E基因型,形成一个独立分支;另外2株风疹病毒属于2B基因型。57株风疹病毒大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了2株风疹病毒在E1蛋白血凝抑制和中和位点区域第212位氨基酸由Thr变为Ser,其他病毒株均无重要抗原位点的改变;所有我国已分离到的1E基因型风疹病毒在E1蛋白第338位氨基酸共享突变位点(Leu338→Phe338),而其他基因型以及其他国家的1E基因型风疹病毒在该位点均未发生突变,提示该氨基酸(Phe338)可能是我国1E基因型风疹病毒所特有。2003～2007年在我国10个省均分离到1E基因型,而2B基因型只在2006年从四川省的越南输入病例中分离到,提示1E为绝对优势基因型,2B基因型为输入基因型。与1979～1984年和1999～2002年我国流行的风疹基因型不同,发生了基因型的更替,近年我国风疹的流行是由1E基因型为主的风疹野病毒的多个传播链引起。

著录项

来源
《病毒学报》 |2008年第1期|7-16|共10页
作者
朱贞; 许文波; 毛乃颖; 蒋小泓; 许松涛; 何吉兰; 孙莉; 凌华; 张珍英; 李聪勇; 巴卓玛; 詹军; 陈慧; 王飞霞; 周淑洁; 陈霞; 郑蕾; 戴德芳; 张红; 梁勇;
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作者单位

北京协和医学院;

中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;

四川省疾病预防控制中心;

重庆市疾病预防控制中心;

河南省疾病预防控制中心;

青海省疾病预防控制中心;

宁夏自治区疾病预防控制中心;

江西省疾病预防控制中心;

安徽省疾病预防控制中心;

山西省疾病预防控制中心;

湖南省疾病预防控制中心;

河北省疾病预防控制中心;

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正文语种 chi
中图分类呼吸道传染性病毒;
关键词
风疹病毒; 基因特征; 基因型;

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