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北京地区呼吸道合胞病毒分离株G蛋白基因遗传变异特性研究

         
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为了解北京地区人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus,HRSV)的遗传变异和分子流行病学特征,首次对北京地区2003～2004年63株HRSV分离株进行了G基因3′末端的第2个高度变异区的序列测定,并进行了基因分型和遗传变异的分析.使用不同的型特异性引物对GPA-F1和GPB-F1分别扩增A、B血清型HRSVG基因3′末端核苷酸序列,特异性扩增产物和随后的序列测定结果均显示,北京地区2003～2004年63株HRSV毒株中,96.8%(61/63)为A血清型,3.2%(2/63)为B血清型,说明北京地区在2003～2004年间存在HRSV A、B血清型共循环,但以A血清型病毒为主.分别对北京流行的A和B血清型病毒进行了基因亲缘性关系分析,结果提示,61株北京A血清型分离株全部为GA2基因型;2株B血清型分离株为GB3基因型.由此看来,GA2基因型是北京地区2003～2004年的优势流行基因型.北京61株GA2分离株之间核苷酸和氨基酸同源性分别在87.8%～100%和77.9%～100%之间;2株B血清型分离株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为94.7%和88.1%.这说明在2003年和2004年有很多个不同的GA2基因型HRSV毒株在北京地区共循环,北京地区的HRSV流行存在着许多由不同病毒株引起的传播链.B血清型分离株Beijing04-11于G基因3′末端含有一个60个碱基的重复序列,这是HRSV多聚酶易于重复复制限定序列的一个极端的例子,有可能是HRSV逃逸免疫压力而不断进化的一种方式.该研究首次对北京地区2003年和2004年流行的HRSV进行了基因分型和遗传变异的研究,对于了解北京HRSV流行株的基因特征具有重要意义,可以为北京乃至中国疫苗株的选择提供参考依据,从而指导HRSV的免疫预防控制.

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