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水稻矮缩病毒基因组第六号片段编码区的cDNA克隆及序列分析

         

摘要

从水稻矮缩病毒(RiceDwarfVirus,RDV)中国福建分离物的基因组中分离出第六号   片段的双链RNA,根据已发表的日本分离物第六号片段cDNA全序列合成了两个寡聚核苷酸引物,经过逆转录合成cDNA,应用PCR方法扩增了编码区的基因序列,并将扩增产物克隆到pGEM3Zf(一)载体上。对重组子进行的限制性酶切分析和DNA序列分析证明,得到的是RDV第六号片段完整的编码序列,进而构建了亚克隆并进行了全序列测定。结果表明,我们所扩增和克隆的片段长1579bp,包含了第六号片段的长153Obp的阅读框架部分,编码一个由509个氨基酸组成的蛋白质,与日本分离物相应序列相比较有较高的同源性,核苷酸序列及由此推算出的氨基酸序列的同源率分别为96.7%和98.8%。

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