SARS病毒再测序DNA微阵列的探针设计

谢建明; 方辉; 陆祖宏; 孙啸

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SARS病毒再测序DNA微阵列的探针设计

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探针设计是SARS病毒再测序DNA微阵列制作的关键步骤 ,为了保证探针的杂交条件尽可能一致 ,采用了作者提出的两种等长变覆盖的探针设计方法 ,即基于Tm距离的算法和遗传算法。针对SARS病毒基因组中的两段特异序列设计了一组探针 ,并与等长移位法和变长变覆盖法的设计结果进行了比较。等长变覆盖法得到的探针集在探针长度一致的情况下 ,探针的Tm值有较小的标准差和变化范围。结果表明 ,等长变覆盖法得到的探针具有更好的杂交条件一致性。

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来源
《生物技术》 |2004年第1期|30-31|共2页
作者
谢建明; 方辉; 陆祖宏; 孙啸;
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作者单位

东南大学分子与生物分子电子学教育部重点实验室;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类病毒（滤过性病毒）;微生物遗传学;
关键词
探针设计; 再测序DNA微阵列; SARS病毒; Tm距离; 遗传算法;

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