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棉花腺苷酸核糖基化作用因子1(arf1)的结构特征、替换剪接和遗传表达分析

         

摘要

用已建立的新型染色体步移技术同尾酶反向PCR和快速分离目的基因cDNA 5′未知序列方法从陆地棉品种Y18中分离到腺苷酸核糖基化作用因子 1(arf1)的全长cDNA、DNA和启动子序列。结果表明 ,该基因全长 436 0bp ,具有 6个内含子和 7个外显子 ,在第一个内含子处存在替换剪接现象 ,使该基因在棉花中分别形成 10 2 6、110 3和 15 4 4bp的 3种mRNA。该基因编码 181个氨基酸 ,转录起始位点上游具有转录起始子、TATA盒、CAAT盒、GC盒、多个正向重复序列和反向重复序列 ,在转录起始位点下游具有富含AT序列和回文结构等启动子特征序列。Southern杂交结果表明 :该基因在棉花基因组中有两个拷贝。Northern杂交结果表明 :该基因在棉花的蕾、花。

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