基于分子对接的新型复合物Ⅲ抑制剂的虚拟筛选

杜士杰; 覃兆海; 许磊

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基于分子对接的新型复合物Ⅲ抑制剂的虚拟筛选

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为了发现更卓越的复合物Ⅲ抑制剂,采用多级递进式筛选法,从Specs数据库中筛选出14个化合物,采用菌丝生长速率法进行了离体抑菌活性测定。结果表明:14个化合物在50μg/mL下对油菜菌核病菌、立枯丝核菌、番茄晚疫病菌、棉花枯萎病菌和番茄灰霉病菌均有一定的抑制效果,其中化合物9对5种病原菌的EC50值分别为8.42、74.89、80.64、96.17和32.94μg/mL,总体活性优于嘧菌酯。为了揭示其内在作用机制,采用分子对接和分子动力学模拟进行了研究,结果发现:化合物9和嘧菌酯在活性位点有相似的结合构象,并均与氨基酸残基Glu (C271)生成了氢键。化合物9的发现对新型复合物Ⅲ抑制剂的开发提供了重要的理论基础和实验依据。

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来源
《农药学学报》 |2020年第6期|942-950|共9页
作者
杜士杰; 覃兆海; 许磊;
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作者单位

铜仁学院材料与化学工程学院;

贵州铜仁554300;

中国农业大学理学院应用化学系农药创新中心;

北京100193;

江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所;

江苏常州213001;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类结构化学;杀菌剂;
关键词
分子对接; 分子动力学模拟; 复合物Ⅲ; 嘧菌酯; 抑菌活性; 虚拟筛选;

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