细菌array-CGH技术用于比较牙龈卟啉单胞菌不同菌株基因组差异的研究

李心悦; 张亮; 吕莉娟; 马健; 周伟平; 黄淑君; 周香城; 贺俊成; 叶宁

首页> 中文期刊> 《口腔医学研究》 >细菌array-CGH技术用于比较牙龈卟啉单胞菌不同菌株基因组差异的研究

细菌array-CGH技术用于比较牙龈卟啉单胞菌不同菌株基因组差异的研究

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

目的:构建牙龈卟啉单胞菌(简称P.gingivalis)全基因组规模的微阵列比较基因组杂交(简称arrayCGH)芯片平台,分析不同菌株间基因组的差异,为后续检测临床分离株的毒力基因,进一步阐述牙周炎发病机制提供依据。方法:综合已经全基因组测序的12株P.gingivalis菌的序列信息,设计探针序列,定制芯片。提取P.gingivalis高毒力株W83和低毒力株ATCC 33277的基因组DNA,利用array-CGH检测其全基因组的差异DNA片段,并运用PCR验证结果的准确性。结果:Array-CGH结果显示两组菌株间存在几个连续片段的拷贝数不同。P.gingivalis W83的部分特异片段参与编码毒力致病因子。在P.gingivalis ATCC 33277的特有片段中,部分编码蛋白可增强细菌表明粘附力,使其具有高粘附力。从中挑选12个基因进行PCR差异性验证,证实与芯片结果一致。结论:用array-CGH芯片的方法来分析全基因组拷贝数的变化具有分辨率高,能精确定位异常片段的特性。本文成功构建了array-CGH技术检测P.gingivalis不同毒力株基因差异的平台,为后续比较临床分离株的差异DNA片段,筛查毒力基因,深入阐述牙周炎的发病机制奠定基础。

著录项

来源
《口腔医学研究》 |2016年第5期|506-509|共4页
作者
李心悦; 张亮; 吕莉娟; 马健; 周伟平; 黄淑君; 周香城; 贺俊成; 叶宁;
展开▼
作者单位

广州医科大学附属广东省妇儿医院口腔科;

广东省妇幼保健院转化医学中心;

广东省妇幼保健院产科;

广东省妇幼保健院口腔科;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类牙周病;
关键词
牙龈卟啉单胞菌; 微阵列比较基因组杂交; 基因组差异;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 牙龈卟啉单胞菌不同菌株多糖诱导THP-1细胞分泌细胞因子的比较分析 [J] . 王依玮 ,湯本浩通 ,刘大力 . 中华口腔医学杂志 . 2014,第002期
2. 牙龈卟啉单胞菌不同毒力株基因差异的比较研究 [J] . 林莉 ,潘亚萍 ,李琛 . 中华口腔医学杂志 . 2006,第012期
3. 不同牙周状态下龈下菌斑中牙龈卟啉单胞菌kgp基因差异研究 [J] . 李琛 ,刘静波 ,潘亚萍 . 口腔医学研究 . 2010,第1期
4. 不同细菌密度的浮游牙龈卟啉单胞菌及其生物膜对甲硝唑敏感性的体外研究 [J] . 段丁瑜 ,王爽 ,张利平 . 华西口腔医学杂志 . 2011,第006期
5. 不同牙龈卟啉单胞菌菌株对人牙周膜细胞MMP-3和MMP-9表达的影响 [J] . 赵戬 ,刘俊超 ,潘春玲 . 武警医学院学报 . 2012,第6期
6. 牙周炎通过牙龈卟啉单胞菌脂多糖作用于中间神经元引发抑郁样表型 [C] . 王艺羲 ,程斌 ,彭云 . 2017全国口腔生物医学学术年会 . 2017
7. 利用细菌array-CGH芯片比较牙龈卟啉单胞菌不同菌株的基因组差异 [A] . 李心悦 . 2016

细菌array-CGH技术用于比较牙龈卟啉单胞菌不同菌株基因组差异的研究

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅