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一种基于极大团扩展的蛋白质相互作用网络可视化方法

         

摘要

后基因组时代,如何从大量的蛋白质相互作用(PPI)数据中寻找特定信息并以图形方式显示是迫切需要解决的问题。为此,本文提出了一种基于极大团扩展的蛋白质复合物聚类算法,该算法通过一种基于极大团扩展的蛋白质符合物识别算法构造功能模块,对PPI网络中的功能模块进行聚类,通过将功能模块用抽象节点代替的方法将PPI网络层次化,这样不但降低了复杂性而且提高了PPI网络中信息的可阅读性。同时采用增加、删除、修改数据的方法对算法进行稳定性分析。结果表明,该算法具有较好稳定性。对于其他具有相似结构的网络,该方法也具有借鉴意义。

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