表达序列标签(EST)分析方法及在植物抗病研究中的应用

吕桂云; 张海英; 郭绍贵; 许勇

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表达序列标签(EST)分析方法及在植物抗病研究中的应用

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在国际最大公共数据库GenBank的dbEST数据库中收录了大量各种生物的ESTs,这些大量的EST序列对发现、克隆和定位新基因,构建遗传图谱,开发分子标记,研究基因差异表达、功能及基因间互作是非常有价值的资源。为了充分挖掘EST数据资源所蕴含的生物学信息,掌握系统的分析方法对其研究显得尤为重要。参照目前广泛运用的多种EST数据分析软件,系统地简述了EST的序列分析方法,主要包括EST的序列分析前处理、序列的聚类拼接以及注释、功能分类,指出应根据EST数据的特征来选择合适的序列分析软件,并阐释EST技术在植物抗病基因的发现、克隆和定位研究中的应用。

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来源
《中国农学通报》 |2010年第8期|56-62|共7页
作者
吕桂云; 张海英; 郭绍贵; 许勇;
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作者单位

中国农业科学院蔬菜花卉研究所;

国家蔬菜工程技术研究中心;

河北农业大学园艺学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类农业生物工程;植物病害及其防治;
关键词
表达序列标签; 序列拼接; 功能注释; 应用;

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